MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Aklavik86 chromosome

Total Repeats: 3589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019563	TTTTA	2	10	2427	2436	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019563	GGT	2	6	4084	4089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019563	TAT	2	6	4132	4137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019563	TGG	2	6	4176	4181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019563	ATGC	2	8	4273	4280	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_019563	TGG	2	6	4289	4294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019563	GTG	2	6	4406	4411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019563	ACC	2	6	4438	4443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_019563	GGT	2	6	4451	4456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019563	A	7	7	4572	4578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019563	T	8	8	4592	4599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019563	AAT	2	6	4613	4618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019563	GAAAC	2	10	4642	4651	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_019563	TAAA	2	8	4683	4690	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019563	AAT	2	6	4723	4728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019563	T	6	6	4728	4733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019563	TTC	2	6	4763	4768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019563	A	7	7	4808	4814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019563	A	8	8	4823	4830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019563	CCT	2	6	4887	4892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_019563	CAA	2	6	4911	4916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019563	TAG	2	6	4921	4926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019563	CA	3	6	4953	4958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019563	TG	3	6	5002	5007	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019563	A	6	6	5037	5042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019563	T	6	6	5107	5112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019563	A	6	6	5148	5153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019563	GGT	2	6	5165	5170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019563	CT	3	6	8715	8720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_019563	T	7	7	8725	8731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019563	AACC	2	8	17393	17400	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019563	A	8	8	17482	17489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019563	A	6	6	17491	17496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019563	T	7	7	18965	18971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019563	A	6	6	18998	19003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019563	A	6	6	20409	20414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019563	A	7	7	20427	20433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019563	T	6	6	20441	20446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019563	TAA	2	6	21829	21834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019563	A	6	6	21889	21894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019563	ATA	2	6	21918	21923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019563	AAT	2	6	21924	21929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019563	A	14	14	21956	21969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019563	GTG	2	6	21992	21997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019563	AAT	2	6	22042	22047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019563	T	6	6	24082	24087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019563	A	7	7	24101	24107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019563	ACC	2	6	24119	24124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_019563	A	6	6	24134	24139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019563	ATGAA	2	10	24141	24150	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019563	A	6	6	24149	24154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019563	A	14	14	24170	24183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019563	ATGC	2	8	24208	24215	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_019563	ATT	2	6	24238	24243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019563	CT	3	6	26276	26281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_019563	CT	3	6	26304	26309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_019563	T	8	8	26309	26316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019563	T	6	6	26352	26357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019563	A	6	6	26400	26405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019563	TGT	2	6	28143	28148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019563	AAT	2	6	28149	28154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019563	ATC	2	6	28206	28211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019563	AC	3	6	30368	30373	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019563	C	6	6	30404	30409	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
65	NC_019563	A	6	6	30414	30419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019563	A	6	6	30438	30443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019563	CCA	2	6	30445	30450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_019563	T	6	6	30497	30502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019563	TG	3	6	30521	30526	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019563	CAC	2	6	30571	30576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_019563	ATAA	2	8	30654	30661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019563	AAG	2	6	30666	30671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019563	A	6	6	30706	30711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019563	AATC	2	8	30713	30720	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_019563	AG	3	6	30742	30747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019563	GTT	2	6	30770	30775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019563	AAAG	2	8	30795	30802	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019563	GATT	2	8	30872	30879	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019563	AAAGA	2	10	30880	30889	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019563	A	6	6	30891	30896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019563	A	8	8	30905	30912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019563	TAT	2	6	30963	30968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019563	T	6	6	31103	31108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019563	AGA	2	6	31114	31119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019563	TTAA	2	8	31133	31140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019563	TATCT	2	10	31155	31164	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_019563	CT	3	6	31208	31213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_019563	A	6	6	31275	31280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019563	TAG	3	9	31298	31306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019563	CAG	2	6	31416	31421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019563	GT	3	6	31433	31438	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019563	AAC	2	6	31464	31469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019563	CTC	2	6	31520	31525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_019563	ACG	2	6	31567	31572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019563	CA	3	6	31754	31759	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_019563	ACC	2	6	31762	31767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_019563	GGCT	2	8	31820	31827	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_019563	AGG	2	6	31898	31903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019563	CCA	2	6	31925	31930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_019563	CCTG	2	8	31939	31946	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_019563	GGT	2	6	31985	31990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019563	GTA	2	6	32082	32087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019563	AGG	2	6	32122	32127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019563	GCC	2	6	32255	32260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_019563	TTCAA	2	10	32273	32282	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_019563	GGGA	2	8	32394	32401	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019563	TGC	2	6	32421	32426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_019563	CTCAT	2	10	32503	32512	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_019563	GAC	2	6	32537	32542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019563	ACG	2	6	32572	32577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019563	AGCT	2	8	32692	32699	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_019563	C	6	6	32717	32722	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
113	NC_019563	GAC	2	6	32814	32819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019563	CGG	2	6	32845	32850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019563	AT	3	6	32862	32867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019563	CTTT	2	8	33049	33056	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_019563	GCT	2	6	33065	33070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019563	CCT	2	6	33081	33086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_019563	GTT	2	6	33088	33093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019563	CA	3	6	33102	33107	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_019563	GTT	2	6	33156	33161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019563	GATT	2	8	33173	33180	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019563	CACC	2	8	33185	33192	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
124	NC_019563	AGC	2	6	33254	33259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019563	TAT	2	6	33289	33294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019563	AT	3	6	33314	33319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019563	GTTT	2	8	33345	33352	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019563	TCC	2	6	33410	33415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_019563	GCA	2	6	33473	33478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_019563	AGT	2	6	33707	33712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019563	TCGC	2	8	33922	33929	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_019563	ACT	2	6	33931	33936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_019563	TCACT	2	10	33981	33990	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_019563	CT	3	6	33998	34003	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_019563	CT	3	6	34118	34123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_019563	TTC	2	6	34226	34231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019563	TACTT	2	10	34280	34289	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_019563	AGA	2	6	34378	34383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019563	T	6	6	34407	34412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019563	TTG	2	6	34447	34452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019563	AACTTG	2	12	34470	34481	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_019563	GTT	2	6	34516	34521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019563	GAAA	2	8	34609	34616	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019563	AGG	2	6	34645	34650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019563	TAAA	2	8	34673	34680	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019563	TCAA	2	8	35005	35012	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_019563	T	6	6	35067	35072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019563	ATT	2	6	35073	35078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019563	A	6	6	35109	35114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019563	GA	3	6	35172	35177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019563	CAT	2	6	35647	35652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_019563	CAA	2	6	37548	37553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_019563	GGA	2	6	37554	37559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
154	NC_019563	GAT	2	6	37596	37601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_019563	GAG	2	6	37631	37636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
156	NC_019563	C	10	10	38544	38553	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
157	NC_019563	CT	3	6	38576	38581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
158	NC_019563	T	6	6	38581	38586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_019563	CT	3	6	38587	38592	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
160	NC_019563	TAA	2	6	39131	39136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_019563	T	6	6	39152	39157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_019563	CTT	2	6	41599	41604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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164	NC_019563	T	6	6	41673	41678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_019563	TAT	2	6	41695	41700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_019563	TAT	2	6	41766	41771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_019563	TGTTTA	2	12	41798	41809	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
169	NC_019563	TTGA	2	8	41830	41837	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
170	NC_019563	TAC	2	6	41905	41910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_019563	AGCG	2	8	41982	41989	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
172	NC_019563	CTTT	2	8	42082	42089	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
173	NC_019563	CAA	2	6	42133	42138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_019563	T	6	6	42157	42162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_019563	TTTA	2	8	42170	42177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_019563	GA	10	20	42313	42332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
177	NC_019563	AAC	2	6	42335	42340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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179	NC_019563	CAT	2	6	42440	42445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_019563	CA	3	6	42529	42534	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
182	NC_019563	CTA	2	6	42565	42570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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185	NC_019563	ACG	2	6	42819	42824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_019563	AAAGAC	2	12	42854	42865	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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188	NC_019563	AAAC	2	8	43033	43040	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
189	NC_019563	GAT	2	6	43052	43057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_019563	AG	3	6	43108	43113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
192	NC_019563	GCA	2	6	43170	43175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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194	NC_019563	TTTC	2	8	43228	43235	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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197	NC_019563	CTT	3	9	43326	43334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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202	NC_019563	TTCA	2	8	46767	46774	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
203	NC_019563	TTCA	2	8	46789	46796	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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211	NC_019563	TCTA	2	8	48352	48359	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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281	NC_019563	GAA	2	6	59531	59536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_019563	CTT	2	6	60228	60233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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294	NC_019563	TTA	2	6	60325	60330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_019563	ATC	3	9	60372	60380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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298	NC_019563	CAT	2	6	60479	60484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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432	NC_019563	TGA	2	6	115283	115288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_019563	ACC	2	6	115386	115391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
435	NC_019563	TGA	2	6	115400	115405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_019563	TAA	2	6	115540	115545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_019563	ATG	2	6	115683	115688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_019563	CAA	2	6	115776	115781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
444	NC_019563	TAT	2	6	115791	115796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_019563	T	6	6	115796	115801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_019563	A	6	6	118239	118244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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466	NC_019563	GTT	2	6	118992	118997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_019563	CTCA	2	8	123590	123597	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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